全世界只有中國在推行眼保健操，而中國學生的近視率卻排世界第二。“打假斗士”方舟子在25日出版的中國青年報撰文稱，目前并沒有什么科學的理論、臨床試驗或調查統計證明做眼保健操確實能夠預防近視，但由于它已成為中國校園文化傳統的一部分，一種東西一旦成為了傳統，就具有了天然的合理性，質疑它會讓人覺得難以接受。
文章指出，其實近視的發生深受遺傳因素的影響。做眼保健操雖有好處卻并非完全無害。
文章說，世界上只有中國在推行眼保健操，而中國學生的近視率卻排世界第二，小學生為28%、初中生為60%、高中生為85%。不做眼保健操的美國，近視率卻只有25%。
文章稱，國內權威媒體曾報道說“有90的孩子近視是由于環境因素不良造成的”，據稱這是專家觀點。而事實上，調查表明近視的產生受遺傳的影響比一般人想像的要大得多。如果父母兩人都是近視，子女也會是近視的可能性高達33~60%；如果父母只有一方是近視，子女近視的可能性降低到23~40%；如果父母兩人都不近視，則子女近視的可能性只有6~15%。
很顯然，近視的發生深受遺傳因素的影響。這個影響究竟有多大呢？通過對孿生子進行比較，可以定量地估計出某種性狀的遺傳率。遺傳率的大小在0和1之間。如果人的視力差異完全是由遺傳差異引起的，遺傳率為1，如果與遺傳差異毫無關系，遺傳率為0。2001年英國研究者對226對同卵孿生成年人和280對異卵孿生成年人的研究表明，近視的遺傳率高達0.89，也就是說，近視主要受基因控制，與后天因素的關系不大。差不多同時丹麥研究者對53對同卵和61對異卵孿生成年人的研究也得出了相同的結論。2004年，英國研究者進一步發現，有一個被稱為PAX6的基因可能與近視有關。
這意味著如果你沒有近視基因，那么不管你在多么惡劣的條件下頻繁用眼，也不會得近視(雖然你的眼睛可能會有其他損傷)。而如果你有近視基因，那么就會逐漸變近視，環境因素是不重要的。不過，基因的表達離不開環境因素的作用，某些環境因素(例如閱讀)可能是近視的誘因。調查表明受教育的程度與近視發生率存在相關性，在某些地方近視發生率逐代增加，都說明某些人在某些環境因素的刺激下，天生就比較容易得近視。
文章說，目前并沒有證據表明有什么可靠的辦法能夠預防近視的發生，也許從小就什么書都不讀，完全去除近視發生的誘因，會是個有效的辦法。例如，在愛斯基摩人中，只有受過正規教育的人才會得近視。但是為了預防近視而去當文盲，這種方法一點也不吸引人。各種預防、逆轉近視的儀器設備(例如至今仍有人在推銷的近視磁療眼鏡)都不過是異想天開。
至于那些有關預防近視的種種“眼睛保健”忠告，也只是想當然爾。遵循這些忠告不會有什么壞處，可能對眼睛還有其他方面的好處，例如消除眼睛疲勞。但是，做眼保健操卻并非完全無害。經常用不潔的手接觸、揉按眼睛，增加了眼睛感染乃至呼吸道感染的風險(病毒會從鼻淚管進入上呼吸道)，并非一個良好的習慣。文章強調，歷經幾十年的代代相沿，眼保健操已經成為了中國校園文化傳統的一部分，變成了一種集體儀式和生活習慣。一種東西一旦成為了傳統，就具有了天然的合理性，質疑它會讓人覺得難以接受，何況是從小就被灌輸的東西，更難以理性地看待。