小兒包莖
包莖就是包皮口狹小，使包皮不能翻轉，從而不能暴露陰莖頭(龜頭)。其病因有先天后天之分，先天性包莖可見于每一個正常的男性新生兒。
孩子出生時包皮與陰莖頭之間粘連，3～4歲時，由于陰莖及龜頭的生長，陰莖勃起，大部分男孩的包皮可自行退縮，外翻包皮顯露龜頭。但部分男孩包皮口細似針孔，包皮不能自行退縮，妨礙龜頭甚至整個陰莖的發育，有的還發生排尿困難。后天性包莖多繼發于包皮過長引起的包皮炎及包皮和陰莖頭的損傷，包皮口有瘢痕性攣縮，皮膚失去彈性和擴張力，使包皮不能向上退縮。
★對策：對于嬰幼兒期的先天性包莖，家長可以在家進行清洗護理。先將包皮反復上翻，以擴大包皮口。此過程手法應輕柔，且每次應適可而止，以免引起患兒疼痛。當孩子陰莖頭露出后,再清潔包皮垢，然后將包皮復原，否則會造成嵌頓包莖。如果包皮口很緊，不能上翻或屬后天性包莖，則應行包皮環切術。手術應在5～6歲時進行，因為此時才可以看出包皮是不是可以自行退縮。一般不主張太早做手術，但如果是反復感染，或是已經有瘢痕形成，甚至是有嵌頓包莖的，就沒有嚴格的年齡限制了。
疝氣(即小兒腹股溝疝)
在胚胎時期，男孩的腹股溝處有一腹股鞘狀突，可以幫助睪丸降入陰囊，出生后，一些男孩鞘狀突關閉不完全，會導致腹腔內的腸管、網膜等進入此鞘狀突，形成疝氣。疝氣可在出生后數天、數月或數年后發生。通常在孩子哭鬧、運動、排便后，腹股溝處會有一鼓起的塊狀物，有時會延伸至陰囊，在臥床休息或睡覺后則自行消失。疝氣嵌頓時會出現腹痛、惡心、嘔吐或哭鬧不安。
★對策：手術是孩子疝氣最好的治療方法。一般皆以全身麻醉，采取高位結扎的方法，安全且時間不長。若孩子有疝氣發生，宜早日治療，以免疝氣囊的內容物發生嵌頓，增加手術的困難和生命危險。
睪丸鞘膜積液
正常胎兒7～9月時睪丸經腹股溝管下降到陰囊，而伴隨睪丸下降的腹膜鞘狀突閉鎖，形成纖維索帶，睪丸部分的鞘突則形成囊狀的睪丸固有鞘膜。當腹膜鞘狀突閉鎖不全時，就會形成小兒睪丸鞘膜積液。
★對策：嬰幼兒鞘膜積液往往會自行吸收，因此，對于積液少且無明顯癥狀者，可不作治療；而對于癥狀重，積液多或交通性鞘膜積液合并腹股溝斜疝者，必須進行手術治療。
隱睪
正常情況下，男嬰的睪丸在胚胎7～9個月時降入陰囊內，約有10％的孩子在出生時仍未降入陰囊，但其中多數在2歲以內降入陰囊。如果2歲以后仍未降入陰囊，睪丸自行下降的機會就減少了。睪丸在下降過程中停留下來，未降入陰囊，便形成隱睪，隱睪多數為單側。
★對策：家長如果發現孩子的陰囊空虛，不能摸及睪丸，或只能摸到一個睪丸時，應立即去醫院診治。目前認為，2歲以后可進行隱睪手術處理，超過5～10歲就有可能影響精子的功能。
尿道下裂
是小兒常見的先天性陰莖發育畸形，在男性新生兒中發病率約為8％，目前認為屬多基因遺傳病，有一定的家族發病傾向。
尿道下裂患兒的尿道開口在陰莖腹側至陰囊會陰的不同位置，尿道開口靠前(即陰莖頭型)的患兒雖不妨礙站立排尿，但陰莖外形多有異常，尿線向下斜；尿道開口在陰莖干、陰囊或會陰者，不僅要下蹲排尿，還可因伴發陰莖下曲畸形，影響陰莖正常發育，至青春期陰莖勃起時彎曲更為嚴重，且可伴疼痛及性生活困難。
★對策：尿道下裂一旦確診宜及早手術，主張在1歲前完成。對于陰莖型合并陰莖下曲畸形較輕者可提前至新生兒期做手術。大多數患兒手術矯正后都可取得滿意效果。
隱匿性陰莖
正常情況下，嬰兒陰莖短小是屬常見生理現象，隨著年齡增長便會漸漸改善。隱匿性陰莖就是正常的陰莖被埋藏于皮下或皮下脂肪之中，因而從外表看來陰莖非常短小。
隱匿性陰莖有真性和假性之分。假性隱匿性陰莖是由于孩子過于肥胖，陰莖埋藏在脂肪層內，所以外露的部分較小。有些孩子在出生時尚屬正常，但如果在生長過程中進食過多，運動量少，一旦脂肪積累，陰莖就漸漸隱埋皮下。真性隱匿性陰莖則由于陰莖在發育時腹部皮膚沒有緊貼陰莖向前延伸，而是直接連接到陰莖頭的冠狀溝部，這時只是見到露在皮膚外的陰莖頭或一些包皮皺褶，而陰莖體被埋于皮下。
★對策：假性隱匿性陰莖只要在發育時適當控制飲食，加強運動而減肥后，情況就會好轉，所以不需要治療。
真性隱匿性陰莖則需要做手術，把陰莖游離出來，將皮膚緊包在陰莖上，使之形成一個圓柱狀，這樣就會還原陰莖的真面目了。治療隱匿性陰莖在可以配合手術的年齡，比如7歲左右就可以動手術。
特別提醒：延誤治療有危害
感染：小兒包莖如不注意清洗包皮垢，經常刺激包皮內板及龜頭，可造成包皮炎及尿道口炎，嚴重者會引起包皮和龜頭潰瘍或形成結石，導致排尿困難。
性生活困難：小兒包莖、尿道下裂、隱匿性陰莖等疾病如不及時治療，成年后將不同程度地影響性生活的正常進行。
影響生育：由于睪丸在腹腔內的溫度比陰囊高，如果未予治療隱睪，將不能產生正常的精子，影響將來的生育。
誘發腫瘤：完全包莖的孩子如果不做治療，由于包皮內炎癥、污垢的刺激，患陰莖癌的幾率會大大提高。隱睪者由于睪丸長期受較高溫度的影響，容易發生惡性腫瘤。
心理負擔過重：上述一些疾病如不及時治療，待孩子懂事后就會背上沉重的心理負擔。比如許多尿道下裂患兒因只能像女孩一樣排尿而被人嘲笑，因此常常不敢上幼兒園或學校。