循環系統
胎兒出生后，由于出現自主呼吸，心臟的動脈導管在出生后關閉， 其血液循環發生重大變化，血液重新分布到肺部，形成新的循環體系。在整個過程中，寶寶的心率波動較大，從140～160次／分逐漸下降，直至110次／分左右。血流主要分布于軀干、內臟，而四肢分布較少。所以四肢發涼，末梢易出現青紫，脾臟相對較大(里面都是血液)。某些新生兒生后1～2天，心前區仍然可以聽到柔和的雜音，幾天后才消失。這往往與動脈導管未閉有關，不一定是心臟有什么問題，請新媽媽大可放心。
泌尿系統
實際上泌尿系統在胎兒期就開始工作了，負責排出尿液形成羊水。新生兒出生時往往膀胱中已有尿液，大多數在出生后6小時排出，少數延遲至第二天才排尿。但如果生后24小時不排尿，應及時找到醫生進行處理。新生兒出生后最初幾天由于攝入水分較少而本身所需水分較多，所以一開始尿量及排尿次數均較少，大約一周后尿量明顯增多，滿月前尿量增至每天250～450毫升。
消化系統
新生兒消化道面積相對較大，能很好地適應大量流質食物的消化吸收。吸吮及吞咽功能完善，協調良好，并能與呼吸同步進行。新生兒出生后10～12小時內開始排出胎糞，為黑綠色，3～4天后轉為過渡性大便，最后變為黃色軟便。若出生后24小時未排便，應檢查有無肛門閉鎖。新生兒胃呈橫位，賁門括約肌發育不良，而幽門括約肌發育良好，但胃容量小，故新生兒易發生溢乳。新生兒唾液分泌及淀粉酶較少，但能適應母乳喂養的需要。
血液系統
新生兒出生時，血液中紅細胞及白細胞數量較多，不久會逐漸下降；但仍與成人的差距甚大，不要用我們的標準去衡量寶寶。
免疫系統
新媽媽小提醒哺乳新生兒娩出后如母體狀況良好，應盡可能在產后半小時內給予母子皮膚接觸，并讓新生兒及早吸吮，這不僅使得出生后的寶寶較早地獲得營養的供給，同時也可促進母親乳汁的分泌。由于媽媽身體里的免疫球蛋白可以通過胎盤傳給胎兒，因此，新生兒出生前對多種傳染病有特異性免疫。但這種被動免疫抗體在出生后逐漸減少以至消失，而免疫功能還沒有發育完善，抵抗力低，故易患多種感染性疾病。因此，對新生兒的居室及用具要清潔消毒，預防感染的發生。另外，因為新生兒能從母乳中獲得某些抗體，母乳喂養的寶寶，其免疫系統的發育要遠優于人工喂養的寶寶。直到成年，這種差距還是非常明顯的。
代謝系統
新生兒代謝旺盛，其體內液體總含量約占體重的80，非常容易出現由于攝入不足而引起的脫水。按體重計算，嬰兒的最低耗氧量比成人高。初生時產熱能源主要來自糖代謝，但因糖儲備不足，故生后頭幾天內機體越來越多地動用脂肪和少量蛋白質產熱。
由于新生兒肌肉和其他組織細胞的數量比年長兒相對較少，故細胞內液的比例較細胞外液相對要少。出生數天內由于丟失較多的水分，可能發生“生理性體重下降”。由于肝臟酶系統發育未成熟，使得新生兒代謝某些化學物質有一定程度的困難，容易發生黃疸甚至膽紅素腦病。
神經系統
新生兒腦體積相對較大，其重量占出生體重的10～12；但腦溝、腦回、神經鞘等，并未完全形成，對下級中樞的抑制能力較弱，容易出現不自主或不協調的動作。新生兒出生時已具備完善的覓食、吸吮、吞咽、惡心、嘔吐、擁抱、握持等一系列生理反射，溫度感覺較靈敏，但嗅覺較弱，聽覺遲鈍。
體溫調節
新生兒中樞神經系統發育尚未成熟，體溫調節機制不完善，加之新生兒皮下脂肪較薄，體表面積相對較大，體溫易受外界環境的影響而發生較大波動。因此，炎熱季節新生兒的臥室應注意通風，并供給足夠的水分；冬天要為新生兒保溫、以防凍傷及硬腫癥的發生。