臨床發現，有的孩子總是胃痛，經尿檢卻發現是患了腎盂腎炎。專家解釋，由于腎盂腎炎是上尿路感染性疾病，孩子又不大會出現尿頻、尿急等膀胱刺激癥狀，所以，往往會忽視了尿檢而得不到明確的診斷。
腎功能不正常時容易出現惡心、嘔吐等消化道癥狀，但對于兒童來說，無論是急性或慢性腎盂腎炎，都容易并發胃十二指腸炎，即使腎功能正常，上消化道癥狀也常常表現突出。此外，由于消化器官和泌尿器官都是人體新陳代謝的兩個始末器官，彼此的功能活動緊密相連，二者很容易同時受損。
一項研究發現，在4～15歲的急性和慢性腎盂腎炎的兒童患者中，絕大部分是女孩，其中71的患兒有胃十二指腸潰瘍炎。