目前為止，尚無治療乙型腦炎的特效藥物，因此該病仍嚴重地威脅著孩子的生命。
在我國多以中西醫(yī)兩法治療乙腦，并且由于醫(yī)務(wù)人員的盡心盡責，密切觀察患兒的病情變化，及時地控制病情的發(fā)展，乙腦的死殘率已較過去明顯降低。在患兒度過急性期后留有的后遺癥，應(yīng)采取中西醫(yī)結(jié)合方法(包括針灸、推拿)進行治療，并應(yīng)加強其功能訓練，如對有智力障礙的孩子，要反復啟發(fā)誘導，從患兒所熟悉的人或物，簡單的文字或詞句開始，鍛煉其記憶力，從而達到恢復智力的目的。
對留有肢體功能障礙的孩子，要每天為患兒按摩數(shù)次，以改善肢體的血液循環(huán)，增加肌肉彈性，以減輕肢體的萎縮，并教育患兒進行主動鍛煉，逐漸促進中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能的恢復；對有吞咽障礙的患兒，則應(yīng)哺喂流汁飲食，由一點一滴地喂，到一口一口地喂，逐步過渡到半流汁飲食，以逐漸訓練患兒的吞咽功能。乙型腦炎恢復期的治療對減少后遺癥十分重要，家長應(yīng)有耐心和愛心，才能使孩子得到最大的康復。
由于本病的死殘率高，因此預(yù)防本病的發(fā)生就顯得特別重要。首先，對生后6個月的孩子就應(yīng)接種乙腦疫苗，直到15歲前的孩子每隔4年都應(yīng)加強接種—次。其次是養(yǎng)成孩子的良好生活習慣，既要有合理的營養(yǎng)，又要有足夠的睡眠，以提高身體的抵抗力。值得注意的是，滅蚊、防蚊是預(yù)防乙腦流行的發(fā)生的最根本措施，積極開展愛國衛(wèi)生運動，清除污水和排除積水消滅蚊子的孳生地是預(yù)防本病發(fā)生的關(guān)鍵。