妊娠后，身體各系統均發生相應的改變，血液相對稀釋，血量相對增多，心、肝、腎等臟器負擔加重，血液中各種激素水平均有變化，從而影響孕婦的全身代謝，導致免疫力下降。
藥物流產術后出血量較多，持續時間長，個別人還需行清宮術方能終止妊娠。
由此可見，任何流產手術都會對機體造成不同程度的損傷，而機體要恢復到孕前狀態至少需要兩周時間。
在此期間，卵巢逐漸恢復排卵，子宮內膜修復，血中性激素降至正常水平。故藥物流產術后應與人工流產術后一樣，預防用藥及全休14天。如果休息不佳，常常會因子宮收縮不良而導致術后出血時間延長，繼發貧血、感染甚至不孕等。