衣原體當人體感染時，可以數月甚至一年沒有明顯的癥狀，但它對女性生殖器官的損害卻一刻也不會停。女性的衣原體感染一般最早發生在子宮頸部位，然后漸漸向子宮、輸卵管及卵巢擴散。如果不加以適當的治療，其結果將是嚴重的盆腔炎癥，可使輸卵管結疤阻塞，最終導致不孕。
盆腔炎的另一個危害是可能導致宮外孕。因為在輸卵管阻塞不通后，受精卵不能到達子宮腔，只好種植在輸卵管并逐漸生長發育。而宮外孕很危險，必須施行緊急手術治療。衣原體感染對孕婦及其胎兒也會構成威脅。感染衣原體的孕婦，其發生流產的可能性增大。另外，衣原體也會通過分娩過程感染嬰兒，導致新生兒眼結膜炎或肺炎。
任何有性生活的人都可能會感染衣原體。作為一種最常見的性傳播疾病，它可以感染所有年齡的人。如果你有一個以上的性伴侶，或者你在最近的3—6個月內有了新的性伴侶，或者你在進行性生活時不采取阻隔式的避孕措施，如應用避孕套、陰道隔膜、宮頸帽等，那么你感染衣原體的機會就會更大；過去患有其它性傳播疾病如淋病或生殖器皰疹的人，其感染衣原體的危險性也會升高；衣原體感染情況也很普遍。衣原體并非僅通過陰道性交的方式傳播，也可通過肛交的方式傳播。
衣原體感染之所以很隱秘，乃因它常常沒有特別的紅斑癥狀。其癥狀表現極普通，易與其它疾病相混淆。更麻煩的是，衣原體感染在4／5的婦女身上根本就沒有任何癥狀。因此，醫生們建議，衣原體感染檢查應作為婦女常規健康檢查的一部分，每年檢查1次，尤其是孕婦更應如此。有一個以上性伴侶的人，或最近更換了性伴侶的人，檢查的次數應更多一些。
感染上衣原體的婦女，在未來月經時有時可發現有黃色分泌物從陰道流出，或者有滴血情況出現；感染情況嚴重的，小便時可有疼痛感或灼燒感，或有尿頻現象；月經期延長、月經量增多或比平常疼得更厲害，有時也會是感染了衣原體。另外，下腹部疼痛伴有發燒，也提示有必要馬上去醫院進行檢查。
衣原體感染用抗菌素容易治療。四環素或強力霉素是治療時最常用的藥物。而孕婦、對其它藥物過敏者，則通常應用紅霉素進行治療。尤為重要的是，患者一定要按醫生處方的規定服藥，即使癥狀已經消失。醫生可能還會讓你定期再來復診，以檢查衣原體感染是否已經徹底治愈。不過，保證該病治愈的關鍵，還是要性伴侶一同治療，以防雙方重新互相感染。
安全性生活的一般準則對預防衣原體感染同樣適用：性交時使用乳膠避孕套，不僅可以防止衣原體感染的傳播，也可預防其它性傳播疾病的感染。對有性生活的人來說，預防衣原體感染最好的方法可能是保持單一性配偶，即你只與一個人保持性關系，而且對方也只與你一個人保持性關系。如果你有一個以上的性伴侶，或者你的性對象有一個以上的性伴侶，那么就要請你的醫生在你每年進行盆腔檢查或身體檢查時，也進行衣原體感染的檢查；如果你的性伴侶有上述任何癥狀，就更要找醫生進行檢查。如果你的性伴侶有任何形式的生殖器分泌物流出、疼痛、潰瘍或尿道灼燒感，則不能與之進行性生活；如果你最近進行了衣原體感染的治療，也不要與你的性伴侶發生性關系，除非你知道他或她不患該病。要記住：衣原體感染是一種危險的、通常看不見的但你需要一直予以警惕的疾病！