在懷孕后期，孕媽咪體內雌激素黃體酮，皮質激素、甲狀腺素也不同程度增高，孕媽咪會產生幸福愉悅的感覺。在妊娠分娩的過程中，體內內分泌環境發生了很大變化，尤其是產后24小時內，體內激素水平的急劇變化是產后抑郁癥發生的生物學基礎。
研究發現，臨產前胎盤類固醇的釋放達到最高值，患者表現情緒愉快；分泌后胎盤類固醇分泌突然減少時患者表現抑郁。研究顯示，產后第1天，游離雌三醇的水平比產前急劇下降，產后第2—3天憂郁產婦雌三醇的水平比非憂郁產婦高，雌二醇沒有明顯的改變。經過對27名孕婦進行激素監測，時間從產前3—5周至產后5—10周，其時進行抑郁量表評定，結果孕激素下降幅度與抑郁量表得分呈正相關，即孕激素下降幅度越大，產后抑郁的可能性越大。
也有研究顯示，產后抑郁與尿中去甲腎上腺素減少有明顯關系，與垂體、甲狀腺功能低下密切相關，憂郁的產婦血清中游離的三碘甲狀腺素(FT3)比正常的低。當然，有關激素與產后憂郁、產后抑郁癥的關系還有待進一步的研究和證實。 遺傳因素：有精神病家族史，特別是有家族抑郁癥病史的產婦，產后抑郁的發病率高，說明家族遺傳可能影響到某一婦女對抑郁癥的易感性和她的個性。文獻還報道，雙生自己家習研究均證實，產后抑郁癥患者家族中，單、雙向情感障礙的發病率均較高。
軀體因素：文獻報道，有軀體疾病或殘疾的產婦已發生產后抑郁，尤其是感染、發熱時對產后抑郁的促發有一定影響。再有中樞神經機能的易感性，情緒及運動信息處理調節系統(如多巴胺)的影響，可能與產后抑郁的發生有關。