(1)四環素族藥物。因該類藥較易于沉積于骨組織，阻礙骨骼發育，服用數月可使牙齒變黃。
(2)維生素K4、K3；磺胺類藥物；新生霉素；三乙酰竹桃霉素；伯氨喹啉等易引起新生兒黃疸。
(3)氯霉素可抑制骨髓，并發灰嬰綜合征。
(4)卡那、慶大霉素療程不要超過10天，以免聽神經及腎功能受損。
(5)鏈霉素對聽神經有影響，且對腎臟不利。
(6)嗎啡、度冷丁、可待因對敏感者易引起中毒，應慎用。
孕婦用藥可通過胎盤進入胎兒體內，哺乳期母親用藥可從奶汁傳給嬰兒。由于新生兒肝臟解毒功能極差，腎排泄功能低，藥物半衰期延長，用藥、用量等必須考慮到；新生兒皮膚細嫩，角化層薄，涂藥易被吸收；新生兒消化道對藥的吸收功能差，口服效果不如靜注。