腎盂腎炎的病因多是由于膀胱中的尿液返流回輸尿管、腎臟而引起。這種返流在多數情況下與憋尿有關。
有資料顯示，女嬰發生輸尿管返流幾率為20％。在兩歲以前有過尿路感染的女嬰中，輸尿管返流的發生幾率為45％。尿液返流的結果不單純是引發腎盂腎炎，在并發腎、輸尿管感染時，還有可能導致出現腎盂腎炎性瘢痕。更嚴重者，甚至有產生繼發性高血壓和慢性腎功能不全的危險。
正常情況下，由于輸尿管和膀胱連接處的特殊生理結構，即便膀胱充盈脹滿，也不會發生尿液返流。相反，在輸尿管和膀胱連接處發育不良、下尿路梗阻、神經性膀胱炎等情況下憋尿，則容易發生尿液返流。當患者憋尿時，尿液由膀胱擠向輸尿管或腎臟，引起腎盂腎炎。
因此，父母應注意不要讓孩子養成憋尿習慣，這對預防返流性腎炎、保護腎臟具有積極作用。