頭痛的原因很多，概略可分八大因素：
1.腦膜炎。
2.腦瘤：顱內的腫塊，使一些動脈和靜脈竇受到牽扯而引起頭痛。
3.發燒或缺氧：顱內血管會擴張而引發頭痛。
4.頭部器官的問題：例如鼻竇炎、青光眼、近視、中耳炎、牙痛，也有可能引起頭痛。
5.睡眠不足、情緒緊張：頭部的肌肉過度收縮，也會引起頭痛。
6.心理因素：如功課壓力，希望獲得父母更多的關心和注意等也會叫頭痛。
7.藥物和鉛中毒。
8.腎臟炎和高血壓：血壓高會引起頭痛，而腎臟炎可引起高血壓，有時也會引起小孩頭痛。
頭痛時如何處理：關于孩子頭痛時該如何處理，方法有二：如果小孩的頭痛由來已久，且每次發作的情形跟以往沒有什么特別，則休息和觀察即可；萬一痛得很厲害又無法入睡，可以吃些止痛藥。而如果頭痛為首次發作，則必須小心注意，最好請專業的醫師檢查，確定非腦瘤或是腦壓升高等潛在因素引起的頭痛，萬一懷疑有上述病變，應該住院做進一步的檢查。
小兒頭痛雖是常見的癥狀，所幸絕大多數都是屬于良性的血管性頭痛及肌肉收縮性頭痛，惟一要注意的是腦部病變引起的頭痛，若未能及時發現，常會遺留嚴重的后遺癥，千萬不可疏忽。