自費疫苗的保護效果較好嗎？有需要浪費這筆錢嗎？
受限于目前疫苗的種類，并無法完全依賴疫苗來預防所有的疾病。凡一種新的疫苗能夠核可上市，必定具有一定的安全性與保護力，且要能夠有效降低目前疾病盛行率的疫苗，才值得研究發展并推廣上市。
而一種疫苗要列為健保的常規接種項目，必須得符合國家防疫政策與經濟效益，接種項目也會因醫療現況而調整，例如：水痘疫苗自民國93年起納入健保給付，而麻疹疫苗則自今年初停止施打。目前仍列為自費項目的疫苗，有些是政府衡量該種疾病在國內的盛行率較低，有些則是尚有其他較經濟的傳統型疫苗可供選擇。
由于目前已是全球化的時代，有些家庭因為工作因素或是異國聯姻，會時常帶著孩子往返國內外，甚至在外地暫居：而隨著國人休閑品質的提升，帶孩子出國旅游的機會也大增。在這樣的環境與社會變遷之下，相對的疾病的傳播交流也更顯得復雜。所以在政府未能全面提供免費施打這些自費疫苗之前，如果希望能讓自己的寶寶擁有全面性的保護(畢竟疾病盛行率低并不等于沒有罹病的機會)，或是希望寶寶在接種疫苗之后，能夠降低副作用發生的機率，就必須自行衡量是否值得為寶寶編列此筆自費疫苗的預算了。
寶寶施打完新型疫苗真的比較不會發燒嗎？
目前上市的疫苗，大多數都有產生發燒的可能性，只是其機率多寡而已。打疫苗為什么會引起發燒或其他副作用呢？有些是疫苗的免疫抗原活性使然，有些則是疫苗其他成分或佐劑造成的影響。最容易產生發燒反應的疫苗，就屬傳統型的三合一疫苗了。由于其中的百日咳疫苗成分未經過純化，接種后引起發燒或局部腫痛、哭鬧等反應的機率較高。
而新型(非細胞型)三合一疫苗，是將其有效免疫成分純化以除掉有害物質，來減少施打疫苗后所產生的不良反應。但必須厘清的觀念是，新型疫苗使發燒的機率減少，并不是代表絕對不會引起發燒原則上發燒是打完疫苗后在一定期間內的預期反應，只要寶寶的活力、胃口無太大影響，對身體并無大礙。畢竟疫苗的反應并非絕對，若真的在意為寶寶花了錢卻還是引起發燒，或許首次接種可先選擇健保的傳統型三合一疫苗，若反應良好則繼續施打，如果出現發燒反應，則視此次副作用的嚴重程度，來決定下次是否選擇改打新型的疫苗。
打完疫苗要揉一揉，聽說揉了效果會比較好嗎？
一般疫苗在施打之后并不需要特別去揉注射部位。打完三合一疫苗之后，如果輕揉兩下，在注射部位比較不會產生硬塊，且能使疫苗產生的抗體濃度較高，只是輕揉之后產生發燒的比例可能會稍微增加。而家長最擔心的就是寶寶發燒，所以通常打完疫苗后，并不會特別提醒家長去揉注射部位，倒不是因為揉了之后疫苗效果會不好的緣故。
口服小兒麻痹疫苗的保護效果優于注射型小兒麻痹疫苗嗎？
口服(沙賓)與注射型(沙克)的小兒麻痹疫苗，兩者的保護效力是差不多的，但也各有其優缺點，必須依照各個國家的防疫政策與經濟狀況來選擇。口服沙賓疫苗屬活性減毒疫苗，優點是方便、便宜，更因為它可以經由糞便排出，使接觸者也同樣受到疫苗的作用，而兼具有群體免疫的效果：缺點則是接種前后半小時需要禁食，且因為是活性疫苗，有75萬～3百萬分之一的機率會引起小兒麻痹癥狀。
沙克疫苗的優點是為非活性疫苗，所以沒有致病風險，但價錢貴(是口服疫苗的幾十倍)則是其最大缺點，此外它也無法引起群體免疫。從前臺灣的小兒麻痹盛行率較高，因此政府全面采用口服疫苗以達成群體免疫：之后隨著多合一疫苗上市與國民經濟力提升，自費選擇含注射型小兒麻痹疫苗的多合一疫苗比例漸增。目前雖然其盛行率已低，但為求加強小兒麻痹的防疫，所以衛生署仍建議選擇接種含注射型小兒麻痹疫苗之多合一疫苗(五合一、六合一)的寶寶，能配合后續疫苗接種的時程，再口服兩劑小兒麻痹疫苗，造福他人。此為國家防疫政策考量，并非疫苗優劣的問題。
Q5懷孕了！到底能不能打疫苗？
懷孕期間的疫苗接種必須特別謹慎評估。所有的活性減毒疫苗都算是孕婦的禁忌，育齡婦女在打完活性疫苗后的三個月內也應避免懷孕。而其他非活性疫苗則需經由醫師評估，認為確實有必要時(如流感疫苗或破傷風疫苗)才建議接種，且有些疫苗必須在懷孕滿一定的周數后施打才安全。一般而言，除非孕婦感染某種疾病的機率很高，或者感染后會造成胎兒很大的傷害，否則并不需要特別在孕期接種疫苗。至于媽媽或其他家庭成員懷孕，嬰幼兒照樣可以接種疫苗，這倒不是寶寶預防注射的禁忌。
打完流感疫苗以后，寶寶為什么一直感冒很難好？
每年打流感疫苗的季節都是在秋末冬初，此時因為季節交替，原本呼吸道疾病的感染率就比較高。接種流感疫苗較常見的副作用為局部酸痛，少數可能出現發燒或倦怠感，但其為非活性疫苗，并不會因為打了疫苗反而得到流感，也絕不是因為打疫苗讓寶寶抵抗力降低而容易感冒。打完疫苗后剛好出現感冒癥狀，通常是之前已受病毒感染，只是尚在潛伏期而未被發現而已。此外要說明的是，流感疫苗只是針對流行性感冒病毒的預防，而會引起一般感冒癥狀的病毒有數百種，所以并不是打了流感疫苗就完全不會感冒，這是以訛傳訛的觀念。